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La configuration géologique du fossé rhénan a doté l'Alsace de nombreux aquifères, aux caractéristiques variées et constituant globalement d'importantes ressources.
La plus importante d'entre elles est la nappe phréatique rhénane. En première approximation Cette dernière se comporte pareillement au schéma de principe précédemment décrit. Ses caractéristiques et les enjeux qui lui sont associés justifient une attention particulière. Tout d'abord cette ressource naturelle constitue un réservoir d'eau d'une capacité exceptionnelle : 35 milliards de mètres cubes rien que pour la partie Alsacienne (50 milliards de mètres cube à l'échelle du bassin rhénan). De plus, cette nappe est peu profonde, donc facilement exploitable. Cette qualité fait aussi sa faiblesse : elle est peu protégée des activités humaines qui l'impacte facilement. Ainsi la qualité de l'eau s'est considérablement dégradée au cours des 50 dernières années. Déjà dans certains secteur la potabilité de l'eau pose question et les usages ont parfois été restreints. La nappe phréatique rhénane est une ressource précieuse et fragile qui motive une politique de gestion à caractère patrimonial.
D'autres aquifères, plus limités en surface et en capacité occupent le sol alsacien. On citera notamment :
- Les nappes qui accompagnent les cours d'eau (Doller, Thur, Logelbach, Giessen, Bruche, Zorn, etc.)
- Les nappes localisées dans la molasse jurassique tout au sud de la région,
- Les nappes superficielles du socle vosgien (elles alimentent souvent des sources)
- Les nappes dans le pliocène de Haguenau
- Les nappes de la zone de fracture (en particulier aux abords de Saverne)
- Les nappes dans les grès.
Pour plus de détails, consulter le site de la DIREN Alsace : www.alsace.ecologie.gouv.fr (rubrique « eaux et milieux aquatiques » / « Eaux souterraines »
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